近日，多名院士、大學教授因陷科研經費腐敗丑聞被查，科技投入問題再次成為社會熱議話題。幾乎與此同時，《關于深化中央財政科技計劃（專項、基金等）管理改革方案》（下文簡稱《方案》）獲批，有力地回應了公眾關切。有專家稱，這一方案的出臺，意味著我國科技投入的管理將出現歷史性轉折。

　　有關統計顯示，我國全國公共財政科技支出每年已超過5000億元，但鮮有世界級科研成果，改變科研經費的配置模式，由此顯得十分迫切。根據《方案》，按照財政部、科技部的規劃，政府將不再直接管項目，分配項目經費、課題經費，杜絕“跑部錢進”。

　　如果能真正做到杜絕“跑部錢進”，這將很大程度改變我國的科研格局。從目前的《方案》看，有杜絕“跑部錢進”的良好初衷，但如果執行、落實不到位，“跑部錢進”會依舊存在，而且可能更甚。另外，要用好科研經費，除改革投入管理之外，必須改革對科研人員的管理、評價，切實建立現代大學制度和現代科研制度。

　　首先，科研資源集中，有可能進一步加劇科研行政化。按照《方案》，將致力于解決資源配置碎片化的問題，進一步聚焦科研項目做大事。資源配置碎片化，在現實中，導致了多頭申報，重復資助，重復投入等問題，這需要治理。但是，把資源全部集中在一起，也意味著權力進一步集中，如果不能有效處理政府與科研基金會的關系，會進一步加劇科研行政化。

　　如果綜合評審委員會的所有專家，都由政府部門聘任，那么，評審權說是在綜合評審委員會，卻仍舊在政府部門；如果綜合評審委員會的評審不獨立，政府部門官員可以左右最終評審結果，那在申報課題時，還會有跑要現象、“戴帽子”項目。

　　其次，科技計劃將科研項目分為五類，有可能被高校、科研機構視為不同等級進行考核。新的科技計劃（專項、基金等）體系，包括國家自然科學基金、國家科技重大專項、國家重點研發計劃、技術創新引導專項（基金）、基地和人才專項，這貌似讓科技計劃成為一個整體，但也帶來另一方面問題，即科研項目，被分為等級。高校和科研機構會按不同的科研項目，對教授、研究人員進行考核。

　　新《方案》并沒有回答怎樣解決這一問題。在筆者看來，解決這一問題的關鍵，在于大學建立現代學校制度，科研機構建立現代科研機構，具體而言，就是在大學和科研機構實行以“學術自治，教授治學”為核心的現代治理，對教師、科研人員的考核標準，應該由教授委員會、學術委員會制訂，并具體執行，而不能由行政機構制訂、執行；學校和科研機構的財務信息公開、透明，接受社會監督。

　　如果大學和科研機構均實行行政治理，把科研項目、經費作為考核教授、科研人員的重要指標，整個學術界就會一直崇尚資源，卻不崇尚學術，那么以整合學術資源為重要特征的新科技體系，難以改變崇尚資源的風潮，科研經費還是難以真正用到刀刃上。