細粒棘球絳蟲的蟲種內存在大量變異，在不同的宿主體內以及不同的地理環境中，蟲種的形態可出現變異，同時其致病性、抗原反應等也有所差異。根據細粒棘球絳蟲相關基因序列分析，分為10個基因型（即G1-G10），在青藏高原地區流行的主要是G1-G3型，而G1-G3型都是綿羊株。

研究表明，我國青藏高原細粒棘球絳蟲可能是由一個起源于中東的有效種群進入該地區后，在高原地區天然的地理隔離作用下，逐漸發展成了現在的種群。

這一點由我國的考古研究所證實，生活在青藏高原地區的藏系綿羊原產于古代中東一帶，自公元651年之后，通過絲綢之路進入中國。因為藏系綿羊是細粒棘球絳蟲最適宜的中間宿主，因此細粒棘球絳蟲很可能是從中東隨宿主動物帶入青藏高原地區。

細粒棘球絳蟲在中間宿主（牛、羊、人等）體內形成可育囊與不育囊，可育囊內有原頭蚴，具有傳染性，不育囊內無原頭蚴，不具傳染性。在各大洲檢查出的包囊中，綿羊體內的可育囊比例在所有中間宿主中都是比較高的。這就提示我們在切斷包蟲病傳播鏈中，防止羊感染是重要的一環。